《锦衣卫》讲述的是明朝时期的故事，皇家亲军锦衣卫侍卫青龙，因发现锦衣卫杀害忠良、勾结奸臣并企图谋反的阴谋而遭到追杀，后终联手正义人士阻击，使其阴谋未能得逞。
    明朝末年，朝政黑暗，皇帝昏庸，阉党乱权。原本由皇帝直接控制的锦衣卫掌控大权逐渐旁落到当朝司礼太监贾精忠手中,贾精忠密谋造反，私通藩王，欲与其平分天下。
       锦衣卫头号高手青龙奉师命盗取勤王兵符却突遭陷害，并遭锦衣卫追杀，与驭天镖局总镖头乔永子女乔花亡命江湖。路遇贾精忠派出的锦衣卫和各路江湖高手追杀，在逃亡过程中，青龙逐渐查清贾精忠图谋造反的阴谋，却与庆亲王派出的净衣派神秘杀手不期而遇。
        在茫茫大漠中，青龙明白，只有战胜这个“杀人武器”，才可能阻止贾精忠和庆亲王的夺权阴谋。一场死战就此展开……